Situado fronte á costa de Nayarit, na Bahía de Banderas, o arquipélago está composto por dúas pequenas illas e dous illotes de orixe volcánica.
A acción do vento, o sol, as choivas e as ondas transformou o substrato, creando diferentes ambientes que orixinan, á súa vez, unha rica biodiversidade. Nas illas Marietas pódese atopar unha gran variedade de aves mariñas residentes e migratorias, entre as que destacan as alcatraces, comúnmente chamadas pechos, gaivotas e pelícanos.
No fondo mariño tamén se descubre unha gran variedade de especies, como moluscos, equinodermos, crustáceos, cnidiarios e elasmobranquios, o que o converte nun lugar moi interesante para o mergullo deportivo e o snorkel. O arquipélago foi recentemente declarado Reserva Especial da Biosfera.